《蛋神Ⅱ》讲述的是来自冻龄世界的布鲁塔和巴克尔,企图征服地球,统治人类,他们要让地球上的大人变小,小朋友不再长。而在这个危机时刻,小朋友玩具陀螺的蛋神觉醒了,热血小孩石牧龙,天才小科学家司想,善良体贴的代家乐,完美女孩上官映雪,四个性格迥异的小朋友因蛋神结缘,它们一起和暗黑势力斗智斗勇。在这个过程中,自称是冻龄世界第二聪明的人,其实却是愚蠢无比的巴克尔,利用女王布鲁塔发明的各种新型“武器”,誓要抢到蛋神。小朋友在和巴克尔的斗争中,建立了深厚的友谊,同时也在相互的帮助下克服了自身的缺点,收获了勇敢、诚实、自信、坚强等优秀品质,懂得了亲情、友情、团结的重要性。