\"故事承接上一季《奇趣特工队之超时空奇兵1。未来世界的大坏蛋柠檬博士颠覆时空，破坏各种影响世界历史的关键时刻。为了守护历史保卫来之不易的现代世界。凯奇、闪电猫、艾尔、嘟嘟公主，四名超能小英雄组成的奇趣特工队联手未来特工青青，化身超时空奇兵。他们穿越各个时空，去往创新发明、伟大历史诞生的关键时刻，与当时的伟人名人联手合作，不断挫败柠檬博士的阴谋。然而柠檬博士不仅没收手反而变本加厉，更想法设法想夺走奇趣特工穿越时空的关键道具。为了阻止柠檬博士，特工们齐心协力，凭借勇敢与智慧，开始了一场比以往更艰巨，规模也更大的时空守护战。
